Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms