Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSSK4Q6SA08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSSK4Q6SA08 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSSK4Q6SA08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms