Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD4Q6IC98 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRAMD4Q6IC98 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD4Q6IC98 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD4Q6IC98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms