Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCARA3Q6AZY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCARA3Q6AZY7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCARA3Q6AZY7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARA3Q6AZY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms