Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LYSMD4Q5XG99 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYSMD4Q5XG99 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms