Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD13Q5VXD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD13Q5VXD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms