Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms