Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGSNQ5TDP6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LGSNQ5TDP6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms