Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ERCC6L2Q5T890 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.05■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.02■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.01■■■■■ 4
ERCC6L2Q5T890 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERCC6L2Q5T890 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
ERCC6L2Q5T890 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6L2Q5T890 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6L2Q5T890 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6L2Q5T890 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERCC6L2Q5T890 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERCC6L2Q5T890 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERCC6L2Q5T890 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6L2Q5T890 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms