Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC183Q5T5S1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC183Q5T5S1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC183Q5T5S1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms