Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD3Q5T2D3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD3Q5T2D3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD3Q5T2D3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms