Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERM1Q5SV97 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PERM1Q5SV97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PERM1Q5SV97 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms