Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP188Q5SRE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP188Q5SRE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NUP188Q5SRE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP188Q5SRE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms