Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD4BQ5PRF9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4BQ5PRF9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms