Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN4Q5MJ08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms