Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNI3KQ59H18 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNI3KQ59H18 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNI3KQ59H18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNI3KQ59H18 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNI3KQ59H18 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI3KQ59H18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI3KQ59H18 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI3KQ59H18 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms