Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSM3Q53FZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACSM3Q53FZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACSM3Q53FZ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms