Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3BQ53EP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3BQ53EP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3BQ53EP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 740.2 ms