Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC184Q52MB2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC184Q52MB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC184Q52MB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC184Q52MB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms