Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DUSP28Q4G0W2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DUSP28Q4G0W2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DUSP28Q4G0W2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms