Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX19Q49B96 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX19Q49B96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms