Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
FHOD3Q2V2M9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
FHOD3Q2V2M9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FHOD3Q2V2M9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FHOD3Q2V2M9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FHOD3Q2V2M9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FHOD3Q2V2M9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FHOD3Q2V2M9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms