Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTL8BQ17RB0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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