Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN3Q16667 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN3Q16667 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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