Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM1Q16610 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ECM1Q16610 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM1Q16610 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM1Q16610 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM1Q16610 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM1Q16610 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM1Q16610 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM1Q16610 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM1Q16610 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM1Q16610 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM1Q16610 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM1Q16610 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM1Q16610 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM1Q16610 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECM1Q16610 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM1Q16610 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM1Q16610 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM1Q16610 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM1Q16610 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECM1Q16610 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM1Q16610 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECM1Q16610 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECM1Q16610 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ECM1Q16610 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ECM1Q16610 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECM1Q16610 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECM1Q16610 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM1Q16610 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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