Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1CQ13936 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1CQ13936 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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