Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5R2Q13319 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5R2Q13319 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5R2Q13319 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms