Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27E3Q08E93 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM27E3Q08E93 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms