Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD47Q08722 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD47Q08722 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD47Q08722 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD47Q08722 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD47Q08722 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD47Q08722 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD47Q08722 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD47Q08722 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD47Q08722 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD47Q08722 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD47Q08722 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD47Q08722 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD47Q08722 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD47Q08722 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD47Q08722 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD47Q08722 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD47Q08722 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD47Q08722 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD47Q08722 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD47Q08722 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD47Q08722 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD47Q08722 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD47Q08722 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD47Q08722 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD47Q08722 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD47Q08722 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD47Q08722 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD47Q08722 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD47Q08722 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD47Q08722 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD47Q08722 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD47Q08722 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD47Q08722 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD47Q08722 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD47Q08722 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD47Q08722 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD47Q08722 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD47Q08722 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CD47Q08722 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD47Q08722 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD47Q08722 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD47Q08722 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms