Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF9Q07011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TNFRSF9Q07011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.2 ms