Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GABPAQ06546 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GABPAQ06546 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABPAQ06546 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GABPAQ06546 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms