Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC25A11Q02978 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC25A11Q02978 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC25A11Q02978 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms