Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDR2Q01850 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR2Q01850 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDR2Q01850 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms