Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBXN2AP68543 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBXN2AP68543 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms