Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A1P68400 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A1P68400 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms