Protein–RNA interactions for Protein: P63000

RAC1, Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAC1P63000 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAC1P63000 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAC1P63000 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAC1P63000 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAC1P63000 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAC1P63000 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAC1P63000 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAC1P63000 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAC1P63000 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAC1P63000 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAC1P63000 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAC1P63000 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAC1P63000 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAC1P63000 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAC1P63000 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAC1P63000 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAC1P63000 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAC1P63000 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAC1P63000 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAC1P63000 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAC1P63000 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAC1P63000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAC1P63000 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAC1P63000 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAC1P63000 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAC1P63000 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAC1P63000 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAC1P63000 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAC1P63000 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAC1P63000 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAC1P63000 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAC1P63000 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAC1P63000 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAC1P63000 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAC1P63000 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAC1P63000 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAC1P63000 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAC1P63000 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAC1P63000 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAC1P63000 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAC1P63000 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAC1P63000 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAC1P63000 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAC1P63000 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAC1P63000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAC1P63000 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms