Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRA2BP62995 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRA2BP62995 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRA2BP62995 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms