Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TMEM258P61165 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TMEM258P61165 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM258P61165 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM258P61165 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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