Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP54P61011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP54P61011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP54P61011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP54P61011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP54P61011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP54P61011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP54P61011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP54P61011 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP54P61011 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP54P61011 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP54P61011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP54P61011 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP54P61011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP54P61011 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP54P61011 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP54P61011 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP54P61011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP54P61011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP54P61011 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP54P61011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP54P61011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP54P61011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP54P61011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP54P61011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP54P61011 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP54P61011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP54P61011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP54P61011 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP54P61011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP54P61011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP54P61011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRP54P61011 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP54P61011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP54P61011 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP54P61011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP54P61011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP54P61011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP54P61011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP54P61011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP54P61011 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP54P61011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP54P61011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP54P61011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP54P61011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP54P61011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP54P61011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP54P61011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP54P61011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP54P61011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP54P61011 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms