Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTTPP55157 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTTPP55157 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTTPP55157 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTTPP55157 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTTPP55157 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTTPP55157 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTTPP55157 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTTPP55157 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTTPP55157 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTTPP55157 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTTPP55157 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTTPP55157 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTTPP55157 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTTPP55157 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTTPP55157 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTTPP55157 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTTPP55157 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTTPP55157 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTTPP55157 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTTPP55157 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTTPP55157 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTTPP55157 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTTPP55157 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTTPP55157 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTTPP55157 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTTPP55157 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTTPP55157 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTTPP55157 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTTPP55157 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTTPP55157 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTTPP55157 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTTPP55157 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTTPP55157 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTTPP55157 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTTPP55157 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTTPP55157 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTTPP55157 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTTPP55157 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTTPP55157 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTTPP55157 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTTPP55157 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTTPP55157 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTTPP55157 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTTPP55157 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTTPP55157 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTTPP55157 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTTPP55157 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTTPP55157 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTTPP55157 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTTPP55157 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTTPP55157 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTTPP55157 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTTPP55157 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTTPP55157 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTTPP55157 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTTPP55157 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTTPP55157 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTTPP55157 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTTPP55157 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTTPP55157 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTTPP55157 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTTPP55157 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTTPP55157 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTTPP55157 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTTPP55157 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms