Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMP3P54852 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMP3P54852 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMP3P54852 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMP3P54852 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMP3P54852 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMP3P54852 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMP3P54852 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMP3P54852 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMP3P54852 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMP3P54852 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMP3P54852 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMP3P54852 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMP3P54852 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMP3P54852 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMP3P54852 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMP3P54852 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMP3P54852 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMP3P54852 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMP3P54852 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMP3P54852 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMP3P54852 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMP3P54852 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMP3P54852 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMP3P54852 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMP3P54852 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMP3P54852 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMP3P54852 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMP3P54852 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMP3P54852 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EMP3P54852 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EMP3P54852 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMP3P54852 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMP3P54852 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMP3P54852 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMP3P54852 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMP3P54852 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMP3P54852 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMP3P54852 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMP3P54852 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EMP3P54852 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMP3P54852 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMP3P54852 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMP3P54852 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMP3P54852 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMP3P54852 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMP3P54852 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMP3P54852 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMP3P54852 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMP3P54852 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMP3P54852 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMP3P54852 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EMP3P54852 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMP3P54852 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMP3P54852 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMP3P54852 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMP3P54852 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMP3P54852 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EMP3P54852 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMP3P54852 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMP3P54852 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMP3P54852 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMP3P54852 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMP3P54852 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EMP3P54852 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMP3P54852 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMP3P54852 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMP3P54852 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMP3P54852 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMP3P54852 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMP3P54852 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMP3P54852 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EMP3P54852 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMP3P54852 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms