Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2JP52435 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2JP52435 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2JP52435 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2JP52435 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms