Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX19P40855 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX19P40855 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX19P40855 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX19P40855 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX19P40855 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX19P40855 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX19P40855 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX19P40855 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX19P40855 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX19P40855 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX19P40855 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX19P40855 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX19P40855 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX19P40855 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX19P40855 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX19P40855 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX19P40855 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX19P40855 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX19P40855 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX19P40855 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX19P40855 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX19P40855 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX19P40855 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX19P40855 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX19P40855 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX19P40855 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX19P40855 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX19P40855 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX19P40855 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX19P40855 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX19P40855 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX19P40855 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX19P40855 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX19P40855 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX19P40855 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX19P40855 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX19P40855 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX19P40855 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX19P40855 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX19P40855 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX19P40855 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX19P40855 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX19P40855 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX19P40855 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX19P40855 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX19P40855 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX19P40855 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX19P40855 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX19P40855 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX19P40855 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX19P40855 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX19P40855 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms