Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCD1P33897 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCD1P33897 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms