Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HOXA7P31268 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA7P31268 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA7P31268 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms