Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA3P29320 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHA3P29320 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA3P29320 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA3P29320 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms