Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDSP20132 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDSP20132 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDSP20132 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDSP20132 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDSP20132 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SDSP20132 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SDSP20132 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SDSP20132 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SDSP20132 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SDSP20132 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDSP20132 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SDSP20132 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SDSP20132 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SDSP20132 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SDSP20132 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SDSP20132 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SDSP20132 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SDSP20132 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SDSP20132 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SDSP20132 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SDSP20132 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SDSP20132 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SDSP20132 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDSP20132 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDSP20132 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDSP20132 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDSP20132 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDSP20132 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SDSP20132 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SDSP20132 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SDSP20132 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDSP20132 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SDSP20132 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SDSP20132 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SDSP20132 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SDSP20132 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDSP20132 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDSP20132 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDSP20132 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDSP20132 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDSP20132 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDSP20132 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SDSP20132 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SDSP20132 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SDSP20132 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SDSP20132 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SDSP20132 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SDSP20132 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SDSP20132 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDSP20132 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SDSP20132 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SDSP20132 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SDSP20132 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDSP20132 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDSP20132 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDSP20132 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDSP20132 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDSP20132 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SDSP20132 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDSP20132 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDSP20132 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDSP20132 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDSP20132 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SDSP20132 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDSP20132 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDSP20132 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDSP20132 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDSP20132 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDSP20132 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDSP20132 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDSP20132 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDSP20132 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDSP20132 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDSP20132 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.4 ms