Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A1P19634 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A1P19634 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms