Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2EP19388 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2EP19388 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR2EP19388 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2EP19388 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms