Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATA1P15976 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATA1P15976 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATA1P15976 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATA1P15976 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATA1P15976 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA1P15976 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA1P15976 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA1P15976 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA1P15976 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA1P15976 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA1P15976 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA1P15976 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA1P15976 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA1P15976 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA1P15976 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA1P15976 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA1P15976 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA1P15976 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA1P15976 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATA1P15976 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA1P15976 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA1P15976 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA1P15976 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA1P15976 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA1P15976 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA1P15976 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA1P15976 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA1P15976 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA1P15976 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA1P15976 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA1P15976 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA1P15976 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA1P15976 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA1P15976 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA1P15976 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA1P15976 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA1P15976 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA1P15976 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA1P15976 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA1P15976 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA1P15976 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATA1P15976 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GATA1P15976 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATA1P15976 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATA1P15976 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATA1P15976 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATA1P15976 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATA1P15976 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATA1P15976 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATA1P15976 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATA1P15976 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms